Для Наполеона стало неожиданностью, что сражение произошло под Малоярославцем. Он предполагал, что российская армия может атаковать его колонны на марше. Утром 12 (24) октября французский император покинул Боровск и направился к Малоярославцу. В дороге он услышал звуки канонады, а вскоре получил донесение Э. Богарне о начавшемся бое. Наполеон направил к принцу своего ординарца Г. Гурго с приказом удержать Малоярославец, обещая подкрепления. Затем он распорядился ускорить выдвижение к городу 1-го армейского корпуса маршала Л.Н. Даву. Между 11 и 12 часами Наполеон прибыл на Бунину гору, с которой открывался обзор всего поля сражения. Там он находился до окончания битвы. Затем император направился в деревню Городня, в 7 км от Малоярославца, где размещалась его главная квартира.
Наполеон не стал продолжать сражение на следующий день, тем самым признав, что его план занять Калугу не удался. Великая армия в ночь на 15 (27) октября двинулась на Боровск и далее на Можайск, возвращаясь в местность, опустошенную войной еще летом.